研究中心下辖4个部、4个研究所，2个产业化基地和12个研究室。

4个部为综合事务部、战略发展部、技术研发部、工程应用部，其中技术研发部下设4个研究所：冻土工程、矿山井壁结构、巷道支护技术和爆破安全技术。

2个产业化基地：安徽蒙城混凝土防水剂材料厂和淮南市顺辉锚固有限公司。

研究所下设12个研究室：人工冻土力学研究室、岩土工程数值仿真研究室、冻结信息化施工研究室、矿山井壁结构研究室、高性能混凝土研究室、矿山地下工程检测研究室、深部岩土力学研究室、巷道支护研究室、岩土锚固与注浆研究室、爆破器材研究室、冲击动力学研究室、爆破技术研究室。